POS機受理銀行卡。
目前銀行POS機能夠受理全國所有帶有銀聯標志的銀行卡消費業務，包括中、農、工、建、交五大國有銀行，民生、光大、華夏等100多家銀聯成員單位。第三方支付機構現在雖然所有銀聯卡都能刷，但是一些規模比較的大第三方只能刷和自己有合作的銀行機構的銀行卡。比如匯付天下。
在這一點上銀行POS機優于第三方支付POS機。
POS機布放費用。
銀行POS機屬于中國銀聯旗下，國內所有收單銀行均屬于中國銀聯或作單位，其POS業務旨在方便不同銀行之間銀行卡的交易，因此銀行POS機安裝過程中不收取商戶任何費用，只收取機具押金，一般在500元左右；但是必須保證商戶在該家銀行的賬戶中具備5萬或者5萬以上的定期存款。當機具商戶不再使用的時候，通知布放機構收回POS機，并全額退回押金，且不收取折舊費。
第三方支付機構的POS機來源主要是從廠家購買。再以原價或高價通過代理商布放其POS機。因為代理商在取得代理資格的同時交納了大額的保證金和代理費，要想盡快收回資本，便在POS機布放的同時向商戶收取費用，按照費率的不同，收取費用也不盡相同。一般0.5%的機具收取2000-3000元之間。1%的費率在1500-2500之間，封頂機具在3000-5000之間，且機具在不使用之后，機具和費用大多不予退還。
在這一點上銀行POS機優于第三方支付POS機。但是銀行POS機需要5萬或者5萬以上的存款這一項相信很多商務不能接受，同時銀行會收取開戶費、密碼支付器費、年費。
POS機消費費率。
國內市場上所有POS機安裝費率，按照中國人民銀行的要求，均要采用銀聯標準。銀行在安裝POS機的過程中自然是嚴格執行自己制定的規定，不然如何能夠讓全國的成員單位滿意。按要求，第三方支付機構必須也要按照銀聯標準執行，但是要知道他們要盈利就必須大量在市場布放機具，靠收取機具安裝費用和刷卡分潤來獲利，在保證獲利的同時還要同銀行等同行業競爭，因此第三方所布放的機具中， 0.5%費率商戶占有相當大的份額。在銀聯執行標準中，只有大型超市，家電賣場等與民生相關的商戶才可辦理0.5%費率機具。
在這一點上第三方支付POS機優于銀行POS機。銀行POS機必須嚴格執行央行費率標準，導致很多商戶必須繳納大額刷卡手續費用，這一點第三方支付就有很大的優勢。
POS機風險控制。
國內所有的POS收單企業都受中國人民銀行的直接監管，銀行和第三方支付機構也不例外。每家POS收單企業也都有自己的風險控制系統。相對來講，銀行因為市場存在時間長，經驗豐富，所以風險控制比第三方支付要更為成熟和穩定。
銀行POS機在持卡人消費之后，資金到達商戶賬戶的時間為第二個工作日。資金在消費至到達商戶賬戶期間，銀聯不參與資金的流轉，只是對資金流轉數據通過系統做出處理。
第三方支付機構POS機現在大部分都是在持卡人消費之后第二個工作日到賬，但是持卡人消費資金首先到達第三方支付機構的賬戶，然后第三方在通過自己的系統，按照POS機的費率扣除手續費之后再轉入到商戶賬戶里面?，F在市場上也存在有部分第三方支付機構的POS機能夠當天到賬或即時到賬。銀行POS機要求所有的商戶銀行卡收單賬戶必須為商鋪對公賬戶，這就降低了資金風險。而第三方支付機構的銀行卡收單賬戶可以為法人的個人賬戶，雖方便了商戶現金的使用，但是資金存在一定風險。
在這一點上銀行POS機優于第三方支付POS機。
但是銀行要求必須對公帳戶，需要準備營業執照、稅務、組織機構代碼證、開戶許可證、企業公章、法人私章、這些東西，如果資料不齊的話，補這些資料需要一筆不少的費用。而且銀行開對公帳戶，刷卡交易進對公賬戶，這樣就會產生一定的稅收。銀行對公帳戶，取款很不方便，必須得開支票去銀行排隊到柜臺取錢。
POS機申請標準。
銀行POS機申請標準要求商戶必須要有實體商鋪，且對該商戶進行實地考察，拍攝商鋪照片，取得商鋪營業執照，稅務登記證，對公賬戶賬號，法人有效身份證件等。通常一個審批下來多則半年少則兩個月。銀行辦理的pos機都是固定的pos機，銀行不可以辦理移動pos機。第三方支付機構POS機申請提供資料只需要營業執照和法人有效證件即可辦理。時間短、能更方便用戶的及時需求，同時第三方可以辦理移動POS機。
在這一點上第三方支付POS機優于銀行POS機。
為了更好的解釋三個機構的區別請看此圖
第三方POS機資金結算流程
銀行POS機資金結算流程
